本宮奉祀之天上聖母原為福建省莆田縣湄洲島聖母廟殿內所奉之正六聖母（林默娘姑婆金身），由興化府林瑞金（本宮主持人先祖）於明永曆十五年間（西元一六六一）為護祐漁民航海安全，恭請聖像抵台奉祀於竹塹城內后圳溝附近（現新竹市大同路）。
清光緒廿二年間（西元一八九五）聖像首次返回湄洲祖廟。
日據時代被迫終止往返湄洲祖廟，暫由竹塹城內鄉民輪流躲藏供奉，至吳刺（即吳金塗岳母）家中而終止習俗。
民國六十年（辛亥年）農曆三月間台北市嘉天宮三媽進香團，行經台一線金塗汽車修理廠停駕起乩認六妹，相約隔年前往笨港口港口宮（明末創建）進香。
民國六十二年（癸丑年）笨港口港口宮正三媽題贈宮名『新后壇』。
民國七十一年（壬戌年）六聖母旨示原地重建至同年十月十二日卯時安座。
民國七十三年（甲子年）因神蹟顯赫，獲得國寶張大千贈字『新后宮』墨寶。
民國七十六年（丁卯年）新后宮供奉湄洲六聖母寶像於解嚴後首次返回祖廟遭當地民眾竊取，六聖母降駕旨示不追究返台。
民國九十二年（癸未年）新后宮正六聖母令廟主第三代改廟名為『天后宮』。
民國一零三年（甲午年）四月廿日正式令第三代繼續傳承廟務運作。
繼林阿嬤年代承傳【天上聖母六聖母】寺廟。
廟內主神供奉：天上聖母、六聖母、大媽、二媽、三媽、四媽、五媽，共六位天上聖母，玉皇大帝、文昌帝君、財神爺、包公爺。
歡迎善信大德前來參拜